中科院武汉病毒研究所研究员石正丽带领的团队采用宏基因组学方法，对我国蝙蝠肠道病毒首次进行了系统研究，在其中发现多种新型病毒。该研究结果对指导未来新病毒的发现和分离有重要意义，日前发表在国际期刊《病毒学期刊》上。
蝙蝠是哺乳动物中仅次于啮齿目动物的第二大类群，也是已知的唯一具有飞翔能力的哺乳动物。如今，越来越多的证据表明蝙蝠是多种新发病毒的自然宿主。
病毒分离一直是最为直接的病毒研究方法，但是在现有实验室条件下很多病毒难以分离；由于病毒之间缺少保守的基因标记，特异性PCR检测难以系统研究样品中的所有病毒。而病毒核酸序列的随机扩增结合高通量测序技术可以全面研究某一生境下的病毒组。
石正丽小组用病毒宏基因组学方法，系统地研究了来自我国湖北、云南、天津等6个不同地区的食虫蝙蝠粪便样品中的病毒。结果显示，蝙蝠肠道中存在有大量浓核病毒、双顺反子病毒、冠状病毒、细小病毒、烟草花叶病毒等。这些病毒的宿主涵盖了脊椎动物、无脊椎动物、植物。而且他们发现的大多数病毒序列与已知的病毒基因组（或蛋白序列）同源性很低，证明蝙蝠肠道有大量新的昆虫病毒、哺乳动物病毒，推测蝙蝠在这些病毒的传播中起着重要作用。
葛行义说，下一步他们会进行更细致的研究，比如找出不同种类的蝙蝠各自携带哪些种类的病毒，哪种蝙蝠携带的病毒种类更多等。