甲型H1N1病毒属于正粘病毒科，甲型流感病毒属，其遗传物质为RNA。典型病毒颗粒呈球状，直径为80 nm～120 nm，有囊膜。
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| 甲型H1N1流感病毒 |
囊膜上有许多放射状排列的突起糖蛋白，分别是血凝素HA、神经氨酸酶NA 和M2蛋白。病毒颗粒内为核衣壳, 呈螺旋状对称, 直径为10nm。猪流感病毒为单股负链RNA 病毒，基因组约为13.6 kb，由大小不等的8 个独立片段组成。尽管不同亚型之间可以组成很多种流感病毒血清型，但是可造成人感染猪流感病毒的血清型主要有H1N1、H1N2 和H3N2。
甲型H1N1病毒为有囊膜病毒，故对乙醚、氯仿、丙酮等有机溶剂均敏感，200 mL/ L乙醚4℃过夜，病毒感染力被破坏；对氧化剂、卤素化合物、重金属、乙醇和甲醛也均敏感，10 g/ L 高锰酸钾、1 mL/ L 汞处理3min，750 mL/ L 乙醇5min，1 mL/ L碘酊5min，1 mL/ L 盐酸3min和1mL/ L甲醛30min，均可灭活猪流感病毒。猪流感病毒对热敏感，56 ℃条件下，30min可灭活；对紫外线敏感，但用紫外线灭活猪流感病毒能引起病毒的多重复活。
甲型H1N1流感病毒是A型流感病毒，携带有H1N1亚型猪流感病毒毒株，包含有禽流感、猪流感和人流感三种流感病毒的核糖核酸基因片断，同时拥有亚洲猪流感和非洲猪流感病毒特征。医学测试显示，目前主流抗病毒药物对这种毒株有效。美国疾控机构的照片显示甲型H1N1流感病毒呈阴性反应。
发现地2009年3月18日开始，墨西哥陆续发现感染、死亡病例。甲型H1N1流感症状与感冒类似，患者会出现发烧、咳嗽、疲劳、食欲不振等。有报道说，美国2009年疫情中发现病例的主要表现为突然发热、咳嗽、肌肉痛和疲倦，其中一些患者还出现腹泻和呕吐症状；墨西哥发现病例还出现眼睛发红、头痛和流涕等症状。 湘雅医院感染病科主任、博士生导师谭德明教授表示，青壮年体内免疫力太强，反而会导致抗体反应过于剧烈，形成“细胞激素风暴”，致使肺部组织严重受伤害。
人的肺部受到流感或呼吸道病毒侵袭时，会出现大量被激活的T细胞以抵抗病毒。T细胞被激活的同时导致人体内细胞激素上升，形成“细胞激素风暴”，使肺部出现炎症。几天后，T细胞促使体内OX40分子增多，而OX40分子向T细胞发出“继续存活”的信号，使T细胞继续在肺部停留，“细胞激素风暴”加剧，肺部炎症加重，最终造成人体免疫系统不堪重负，危害人体健康。所以发病人群多为青壮年，而不是季节性流感的易感人群——老人和儿童。